167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1601 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 346 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 346 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  99.42 
 
 		 344 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  99.7 
 
 		 336 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  99.37 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  94.17 
 
 		 240 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  71.49 
 
 		 240 aa  345  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  67.78 
 
 		 240 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 242 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  67.95 
 
 		 240 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  67.09 
 
 		 240 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 		 149 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  62.2 
 
 		 266 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  65.11 
 
 		 252 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  61.51 
 
 		 239 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  55.95 
 
 		 240 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  57.02 
 
 		 239 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 239 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  55.74 
 
 		 242 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 		 234 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  54.89 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  53.56 
 
 		 241 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  52.94 
 
 		 245 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  48.51 
 
 		 233 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  48.51 
 
 		 233 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 241 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 241 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 203 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 203 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 240 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 233 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 237 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  47.01 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 248 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  47.21 
 
 		 235 aa  192  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 233 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 233 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  48.54 
 
 		 242 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 233 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 99 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.6 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  34.38 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2681  putative dehalogenase  96.55 
 
 		 70 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335846  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 234 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 230 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 234 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.48 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.52 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 247 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  39.39 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.51 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  29.67 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  33.48 
 
 		 234 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  28.17 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  25.7 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.41 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  30.33 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  22.17 
 
 		 223 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  28.16 
 
 		 220 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 260 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  29.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  35.25 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  25.37 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  33.59 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.24 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  24.19 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  24.19 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  28.97 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>