231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0978 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  55.56 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  55.23 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  47.15 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  47.15 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  47.15 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  42.61 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  43.05 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  46.97 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  45.45 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  45.96 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  39.59 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  39.59 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  39.18 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  38.37 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  46.15 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  38.37 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  38.37 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  45.03 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  44.39 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  42.42 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  38.37 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  45.45 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  45.31 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  41.24 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  41.31 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  45.31 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  43.81 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  40.67 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  42.05 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  39.21 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  40.83 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  39.39 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  35.22 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  40.09 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  35.81 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  35.96 
 
 		 227 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  42.78 
 
 		 234 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  37.09 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  40.21 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  39.18 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  39.18 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  35.71 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  37.37 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  44.97 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  38.24 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  32.65 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  32.45 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  34.85 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  34.67 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  31.09 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  32.74 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  37.36 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  31.44 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  36 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  31.4 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  28.35 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  29.9 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  29.08 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  28.06 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25.39 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  25.91 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  34.15 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  34.15 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  29.13 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  33.66 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  33.01 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 346 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 346 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  34.19 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  26.02 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  25.35 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  25.87 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  25.87 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>