202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4220 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  68.05 
 
 		 240 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  66.39 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  66.39 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  66.39 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  65.97 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  67.63 
 
 		 266 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  67.22 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 346 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 346 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 336 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 344 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 316 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  65.53 
 
 		 240 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  65.11 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  62.34 
 
 		 240 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  66.52 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  56.17 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  52.14 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  48.96 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  46.81 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  44.92 
 
 		 241 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  51.71 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  54.27 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  50.83 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  47.86 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.78 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  47.44 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  42.98 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  44.83 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  44.83 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  50.85 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  46.35 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  47.5 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  67.59 
 
 		 149 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  52.68 
 
 		 203 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  52.68 
 
 		 203 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  47.93 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  41.2 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  38.08 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  39.11 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  32.08 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.19 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  67.61 
 
 		 99 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.98 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.11 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.45 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  28.22 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.54 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.3 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  39.42 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  34.04 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.26 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  30.54 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  28.78 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  30.59 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.07 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  34.43 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.32 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  30.4 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  29.56 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.25 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  25.22 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.36 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  26.78 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  26.78 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  26.78 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  24.43 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.97 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  27.63 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  30.89 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>