187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2306 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  100 
 
 		 241 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  61.14 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  44.77 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  45.19 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  42.54 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  38.84 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  35.04 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  36.91 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  36.48 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  36.05 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.96 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  36.48 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  34.93 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  33.47 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.33 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.91 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.75 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  32.62 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.27 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  32.91 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.07 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  35.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31.44 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  32.32 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  30.65 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  31.66 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  31.31 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0145  hypothetical protein  27.76 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31.31 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31.31 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.26 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  29.79 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  30.17 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  29.8 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  28.16 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  28.23 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0260  hypothetical protein  25.31 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  27.66 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  25.68 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  28.94 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.39 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  25 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  26.38 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  26 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 346 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 346 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.56 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.06 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  24.43 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  24.04 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  27.36 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  24.42 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  25.54 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  25.1 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>