177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6092 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  97.3 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  82.43 
 
 		 222 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  73.42 
 
 		 222 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  73.42 
 
 		 222 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  73.42 
 
 		 222 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  72.97 
 
 		 222 aa  351  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  72.97 
 
 		 222 aa  351  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  68.92 
 
 		 222 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 		 222 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  61.99 
 
 		 221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  61.26 
 
 		 222 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  59.91 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  59.01 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  59.46 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  58.82 
 
 		 221 aa  288  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  58.11 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  57.47 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  58.56 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  57.66 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  58.37 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  57.4 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  57.4 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  55.71 
 
 		 223 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  56.62 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 279 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31.66 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  31.42 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.73 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  22.57 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.88 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.37 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.14 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.89 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.89 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.37 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.74 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.94 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  29.26 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.96 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  23.88 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.96 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.06 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.13 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.78 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  25.42 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  28.18 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  25.84 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.46 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  24.73 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.14 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.14 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  24.5 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  27.13 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.19 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  23.25 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  29.13 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  33.01 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.07 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  23.24 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  23.01 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  32.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  22.32 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 346 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 346 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 344 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 336 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  25.93 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  26.25 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  31.13 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  24.39 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  32.04 
 
 		 149 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>