119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2178 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  80.7 
 
 
241 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  66.81 
 
 
236 aa  315  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  52.36 
 
 
238 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  51.28 
 
 
237 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  50.65 
 
 
239 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  53.45 
 
 
236 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  50 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  52.47 
 
 
237 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  49.34 
 
 
248 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  48.48 
 
 
266 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  48.12 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  49.12 
 
 
243 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  47.68 
 
 
236 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  47.68 
 
 
237 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  45.53 
 
 
243 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  33.75 
 
 
297 aa  131  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  33.75 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  36.56 
 
 
242 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  37.23 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  32.91 
 
 
241 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.56 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  35.4 
 
 
247 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  35 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  32.65 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  32.65 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  30.69 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  29.59 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  28.57 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  28.83 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  30.14 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.67 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  29.59 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  28.85 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  27.49 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  29.08 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  27.55 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.63 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  28.93 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  26.83 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.62 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.62 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  26.29 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  28.71 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  30.8 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  31.1 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.41 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  30.17 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
346 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
346 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
336 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  26.56 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  24.08 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  25.51 
 
 
240 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  32.85 
 
 
243 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.48 
 
 
248 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29.5 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.23 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  23.27 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  23.12 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  23.27 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.37 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  28.87 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>