101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5632 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  91.4 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  77.83 
 
 		 221 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  65.02 
 
 		 222 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  66.36 
 
 		 223 aa  308  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  64.09 
 
 		 222 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  62.73 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  65.75 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  64.84 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  64.09 
 
 		 222 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  64.38 
 
 		 222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  64.13 
 
 		 222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  61.99 
 
 		 222 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  61.99 
 
 		 222 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  64.09 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  62.27 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 222 aa  297  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 222 aa  297  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 222 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  60.63 
 
 		 222 aa  294  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  61.19 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  59.28 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  58.9 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  57.47 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  56.56 
 
 		 222 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  56.56 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  51.58 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  32.37 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  31.66 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  23.64 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  29.09 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.78 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  28.57 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.27 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.27 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  21.82 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  23 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.62 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.89 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  25.35 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  26.5 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.5 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.42 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  24.76 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  24.76 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.5 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  24.29 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  24.29 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  22.22 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.12 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  31 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.93 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  30.97 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  31.37 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  24.31 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  23.21 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.83 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  24.27 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  24.68 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  22.93 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  23.32 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  24.44 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  29.7 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.25 
 
 		 234 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  29.91 
 
 		 240 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.26 
 
 		 240 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  24.47 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  24 
 
 		 271 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.81 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>