162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1501 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  42.34 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  28.97 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  25.28 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.63 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.46 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  38.75 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.34 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  23.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  39.6 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.31 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.08 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  26.69 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  38.71 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  43.9 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  25.93 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  39.78 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2811  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.23 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  36.14 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.46 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  39.51 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  28.42 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  28.49 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  41.1 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  24.86 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  39.24 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  28.28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  38.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  40.54 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  38.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  38.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  38.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  38.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  43.14 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  25.11 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  40.79 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  43.86 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.25 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  22.82 
 
 		 300 aa  48.5  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.99 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  28.12 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  33.33 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.62 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  23.15 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.27 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.82 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.39 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  36.67 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.93 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  25.37 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.07 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.07 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.11 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.13 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  45.1 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  41.43 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  26.26 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  46.94 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  34.12 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  25.87 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  34.15 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>