289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1992 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.94 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.62 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.65 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  25.51 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.03 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.78 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.34 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.27 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.07 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  34.85 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  23.63 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.59 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.23 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  28.67 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.5 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.38 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  25.99 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  37.8 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25.76 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.99 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.92 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  22.04 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.78 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.63 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.68 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.04 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  24.28 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  31.2 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  24.89 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  30.83 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.03 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.13 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  23.27 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.81 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.52 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.9 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  30.82 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  26.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.2 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  26.43 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.62 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  26.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.25 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.87 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  26.69 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  23.95 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.21 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.37 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.68 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.5 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  25.71 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.72 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.46 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>