More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1113 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  100 
 
 		 228 aa  450  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.89 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.1 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  34.06 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  34.11 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.03 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  32.95 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  34.68 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  32.95 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  38.83 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  34.42 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.63 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  30.8 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.62 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  30.47 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  30.37 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25.13 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  30.84 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  30.24 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  29.61 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.62 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  24.62 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  33.04 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  38.33 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.12 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.78 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.12 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  31.06 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  25 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  45.16 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.33 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.62 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.93 
 
 		 298 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  29.44 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.29 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  28.5 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  42.37 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  36.3 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  36.21 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38.4 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  27.15 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  34.71 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.11 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.63 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.27 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.96 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.87 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  37.76 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.05 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.01 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.08 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  30.5 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.73 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>