More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1747 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  100 
 
 		 243 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.22 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  48.05 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.64 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.02 
 
 		 583 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  30.17 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.3 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  34.52 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  30.71 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  35.1 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.44 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.25 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  42.37 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  24.47 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  35.05 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.04 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  24.89 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  35.94 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  24.47 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.53 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.48 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.94 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.97 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  22.08 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.06 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  40.57 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  21.15 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.27 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.63 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  32.38 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.63 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  34.38 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  24.46 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  29.6 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.61 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.95 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.41 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  26.64 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.22 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.8 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  28.57 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.72 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.4 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  34.13 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  26 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.8 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.82 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.9 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.36 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  35.38 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.74 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0262  HAD family phosphatase  38.18 
 
 		 166 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.74 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.05 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 562 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.06 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  37.78 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>