231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  59.91 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  55.84 
 
 
235 aa  248  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.09 
 
 
230 aa  237  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  57.4 
 
 
230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  57.4 
 
 
230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  57.4 
 
 
230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  51.57 
 
 
230 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  46.96 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.2 
 
 
232 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  41.97 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  39.47 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.67 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  36.96 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.32 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.19 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  34.04 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  32.29 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  30.3 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.94 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.41 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
233 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.36 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.16 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  29.37 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.25 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  32.48 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.25 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.23 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  28.19 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.97 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.97 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  32.99 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  25.12 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.04 
 
 
231 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.26 
 
 
224 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.43 
 
 
244 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  25.83 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.94 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.71 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.59 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.26 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.93 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.5 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  32.12 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  32.12 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.37 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
203 aa  48.5  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.69 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  37.35 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  26.99 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  31.37 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.67 
 
 
212 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
220 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.4 
 
 
224 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.27 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
212 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  32.12 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  31.37 
 
 
216 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.41 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.84 
 
 
211 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  39.08 
 
 
228 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  26.29 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.63 
 
 
213 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.7 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  27.88 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>