229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2297 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  61.7 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.22 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  33.56 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  30 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  33.55 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  33.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.61 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.95 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  34.86 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.97 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  26.07 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.37 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  29.34 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  29.61 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.76 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  35.65 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  29.37 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.53 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  29.56 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  36.54 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.04 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.66 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  27.48 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  30.67 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  27.48 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  29.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.11 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  28.95 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  26.63 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.78 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.79 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  28.95 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  32.58 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.58 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.56 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.63 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  29.71 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  26.63 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30.56 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.27 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  29.37 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.75 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.62 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  28.12 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.82 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.72 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  33.66 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.45 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  31.54 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  30.5 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  26.35 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  25.35 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.53 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  29.46 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  26.36 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  29.46 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  29.46 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.67 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.63 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.02 
 
 		 583 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.47 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32.99 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  24.88 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.4 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  23.17 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  24.52 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>