257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1054 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
244 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  61.7 
 
 
248 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.96 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  35.06 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  36.09 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  35.06 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.66 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  38.54 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  35.61 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.07 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  33.85 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  35.61 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.04 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  37.89 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  33.56 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  28.74 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.65 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  32.89 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  32.89 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  33.81 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  34.06 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  33.85 
 
 
225 aa  55.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  35.79 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.62 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.85 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  33.83 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.94 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  33.08 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  29.05 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  30 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  32.31 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  35.44 
 
 
255 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  35.79 
 
 
220 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
221 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.75 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.62 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.11 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.85 
 
 
583 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  43.86 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  32.82 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  41.54 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 
349 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.94 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.04 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.8 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  42.62 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.9 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
216 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  29.15 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  30.36 
 
 
241 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  37.5 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  24.77 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  33.58 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  35.88 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  27.02 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  43.33 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  35.11 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  24.39 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.78 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.76 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  35.04 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.63 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.68 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  36.36 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  35.42 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>