More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2083 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
178 aa  348  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.05 
 
 
178 aa  192  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.25 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.23 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.81 
 
 
217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
221 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
214 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  29.12 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  29.12 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  29.12 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  29.12 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  42.05 
 
 
256 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.34 
 
 
229 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
240 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
208 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 
242 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
229 aa  57.4  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 
204 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 
618 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
238 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  27.01 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
223 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
257 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 
232 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 
224 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.65 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  49.18 
 
 
223 aa  54.7  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 
225 aa  54.3  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 
212 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
235 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.43 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0815  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.49888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  35.09 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
226 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 
229 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.97 
 
 
209 aa  52  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
212 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
254 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
231 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  40.51 
 
 
225 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
225 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  29.32 
 
 
231 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
254 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
227 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
254 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
225 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
225 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  41.27 
 
 
221 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
228 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  32.79 
 
 
170 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  41.54 
 
 
262 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  28.74 
 
 
206 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  25 
 
 
239 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  26.35 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.66 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  41.89 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1216  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.67 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.556925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
272 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.07 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  46 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
272 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.63 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  25.4 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  27.71 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  39.02 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  22.91 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
227 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  24.42 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 
228 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  25 
 
 
228 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.2 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  41.27 
 
 
261 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>