More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1573 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  100 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  77.19 
 
 		 234 aa  349  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0328  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  46.79 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0916  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.5 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  33.57 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.65 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.02 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.35 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.09 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.53 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  32 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  26.75 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  29 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.54 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  46.58 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  32.48 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  37.23 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  30.52 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  30.52 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  26.78 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  30.52 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  30.96 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.87 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  27.13 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  33.64 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  30.92 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.91 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 		 272 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  33.1 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  32.79 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  32.84 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  32.93 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  29.76 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.96 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1688  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.76 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  27.16 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.49 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.58 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2839  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0722376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>