More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0508 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.68 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.15 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  34.96 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.68 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.54 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  57.78 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  30 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  33.61 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  46.38 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
257 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.89 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  37.65 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.85 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
256 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  35.92 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  47.27 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
251 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.16 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0135  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.15 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  28.23 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  50.85 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  40 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.62 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  37.37 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  36.47 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  38.46 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  35.61 
 
 
234 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  37.68 
 
 
217 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
221 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  35.87 
 
 
221 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
221 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  45.45 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  45 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  33.07 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.81 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  43.9 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  39.19 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 
217 aa  51.2  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.13 
 
 
296 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.47 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.47 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.94 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  44.64 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  39.71 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  34.48 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.08 
 
 
396 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  35.38 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  35.14 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  37.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  55.1 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  44.64 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  37.8 
 
 
244 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  46.67 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  26.99 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.84 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  53.06 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.94 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  36.05 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  36.92 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  46.81 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>