More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2933 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  63.9 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  59.02 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  57.71 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.61 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.44 
 
 		 206 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  56.72 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  37.88 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 236 aa  131  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  34.76 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  36.87 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  37.82 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 		 247 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  37.3 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  35.1 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.45 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  26.9 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  26.9 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.46 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.49 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.24 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.9 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  24.37 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.13 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  25.27 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.7 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.06 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.49 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  26.23 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.41 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  28.65 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  28.73 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  27.22 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 272 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  27.22 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.56 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  41.25 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0128  phosphoglycolate phosphatase  30.51 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.82 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.81 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  25.37 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  23.2 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.08 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.98 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  37.8 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  37.8 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  37.8 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>