More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2173 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  57.08 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.67 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.96 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.79 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.63 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  41.18 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  40 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  37.3 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.32 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  41.4 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.32 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  34.65 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  34.95 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  32.8 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.19 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.82 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.94 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  25.4 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.83 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.77 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.56 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.07 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.12 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  25 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.42 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  23.32 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  23.73 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.45 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.76 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  26.01 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  26.01 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0806  HAD superfamily hydrolase  22.51 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0727233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.43 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  23.94 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  27.38 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.35 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  23.43 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  25.29 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.38 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.14 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.19 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  25.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.09 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  27.08 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.55 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1071  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357132  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  21.55 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  21.55 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>