More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1697 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  65.38 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  57.08 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.76 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.83 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.63 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  42.36 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.46 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.86 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.3 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  38.35 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  39.68 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  37.82 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  37.5 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  34.88 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  36.02 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  34.07 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  36.93 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  38.69 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  38.69 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4225  phosphatase-like  38.95 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1071  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357132  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  37.06 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  38.37 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  38.37 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.39 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.75 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.76 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.29 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  33.71 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  34.64 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  32.2 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.86 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.35 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  25.14 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.49 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  32.22 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  29.2 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  31.25 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  30.51 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.62 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.37 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  29.41 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.98 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.79 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>