More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0404 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  48.79 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.25 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  48.83 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.44 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  42.11 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  41.87 
 
 		 206 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.19 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.12 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.61 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  38.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  39.7 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  32.7 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  34.31 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  32.68 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.23 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.73 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.73 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.66 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  28.79 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.76 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.94 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.87 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.83 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  25.42 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.49 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.12 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  25 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  24.29 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.73 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.32 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.96 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  32.79 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29407  predicted protein  25.23 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160817  normal  0.108947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.03 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  25.95 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.13 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  34.07 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.7 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  28.71 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  29.83 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  28.5 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.16 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>