More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1559 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  62.11 
 
 
214 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  56.19 
 
 
202 aa  204  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.38 
 
 
199 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.85 
 
 
204 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  56.41 
 
 
209 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  49.73 
 
 
196 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  53.59 
 
 
197 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  53.55 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  52.08 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  54.1 
 
 
198 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  53.55 
 
 
198 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  53.55 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  53.55 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.98 
 
 
198 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  50.29 
 
 
184 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.11 
 
 
210 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  48.44 
 
 
197 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  46.96 
 
 
185 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  34.22 
 
 
203 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.95 
 
 
204 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.95 
 
 
204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  38.95 
 
 
204 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  38.95 
 
 
204 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  38.37 
 
 
204 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  35.08 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  35 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  32.11 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  36.14 
 
 
202 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  36.7 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  33.73 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  31.85 
 
 
172 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.73 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.68 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  36.11 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.96 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  27.59 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  37.82 
 
 
242 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
226 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  32.39 
 
 
264 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  24.43 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.78 
 
 
296 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
266 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.45 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.7 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.27 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
319 aa  54.7  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3398  phosphoglycolate phosphatase, putative  25 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
468 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.05 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  37.04 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.86 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  37.04 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.24 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
261 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.42 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  31.05 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  30.46 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.28 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.74 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.19 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  28.04 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.88 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.19 
 
 
327 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.42 
 
 
215 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.15 
 
 
223 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
238 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  29.55 
 
 
234 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
223 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>