More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3208 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  44.08 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0135  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.18 
 
 		 272 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.29 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  25.43 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.76 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  34.59 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  23.78 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.79 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.76 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.14 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.55 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  23.89 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  23.89 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  25.97 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  23.89 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.17 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  26.13 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.56 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.91 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.34 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.09 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  24.72 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  24.72 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.29 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.72 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  25.14 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  24.16 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  22.35 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  30.1 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  24.11 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  23.29 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.69 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  23.61 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.58 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  23.4 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.69 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.08 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.15 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  39.08 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  22.94 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.45 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  39.08 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  39.08 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.36 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  21.74 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  24.74 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  24.74 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.13 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  24.2 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  28.02 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>