More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0962 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  84.89 
 
 
236 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  84.89 
 
 
236 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  84.89 
 
 
236 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  45.26 
 
 
217 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  31.66 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.09 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.61 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.62 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  34.41 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  29.38 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.67 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.84 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  27.04 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  26.27 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.84 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  23.9 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  27.67 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  27.67 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  29.32 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.32 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.35 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.89 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.85 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.15 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.69 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.41 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27 
 
 
215 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  26.27 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.58 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  31.55 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.5 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  27.5 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  30.32 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>