237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0523 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  47.8 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  47.12 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  49.73 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  45.5 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  48.12 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  41.8 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  39.46 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  37.43 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  39.11 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  40 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.77 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  39.77 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  39.77 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  39.77 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  39.2 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  31.52 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.89 
 
 		 319 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  31.38 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  34.16 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  33.54 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  29.75 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.42 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  28.9 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  31.06 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.32 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.45 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0135  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.85 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  27.22 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  26.07 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  27.6 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 735 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  28.34 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  23.4 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  30 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  27.63 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.09 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  21.46 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  25.54 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  22.22 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.4 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  32.5 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.38 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.97 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  28 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  24.21 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.78 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  28.3 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>