More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1710 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0135  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.7 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  44.08 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.64 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  28.64 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  28.12 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  28.64 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.12 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.12 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.18 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  28.38 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.19 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  37.01 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  37.8 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.37 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  26.07 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  33.11 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.22 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.18 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.24 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.56 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  28.26 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  33.86 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.73 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  27.53 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  23.89 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  32.04 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  34.13 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  29.38 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>