More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0499 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  56.54 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.02 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  56.02 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  53.33 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  54.97 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  53.93 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  52.88 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  52.88 
 
 		 206 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  52.88 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  48.99 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  40.53 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  39.46 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  39.75 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  38.34 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  37.64 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  38.27 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  39.76 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  41.24 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  42.54 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  39.02 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  43.11 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  42.51 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  40.72 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  41.42 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.8 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.56 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.25 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  40.72 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  40.72 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  38.92 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  35.08 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  36.09 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  34.95 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  33.52 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  33.52 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.11 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.15 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  31.32 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  29.88 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  31.18 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  30.22 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.87 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  30.96 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  33.14 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.68 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.47 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.29 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.72 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  29.31 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.28 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.22 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.29 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.89 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  27.49 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  27.32 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.06 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 		 273 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  28.25 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.86 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  28.96 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>