More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4915 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  75.38 
 
 		 196 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  83.42 
 
 		 197 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  83.59 
 
 		 196 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  78.69 
 
 		 184 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  83.59 
 
 		 196 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  83.59 
 
 		 196 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.35 
 
 		 198 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  73.68 
 
 		 197 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  71.81 
 
 		 198 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  70.05 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.45 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  65.36 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  55.05 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  52.08 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.25 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.48 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  49.19 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  53.48 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  39.55 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  40 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  40 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  38.92 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.36 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  35.63 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  35.63 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  31.58 
 
 		 172 aa  88.2  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  29.94 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  30.43 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  31.21 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  30.9 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  25.44 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  37.06 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.89 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.73 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  32.74 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.14 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 252 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.48 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  32.62 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  31.49 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  31.18 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3398  phosphoglycolate phosphatase, putative  26.6 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000172911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  30.35 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.21 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  29.26 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  36.64 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  36.64 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.72 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.72 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  23.38 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0916  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.34 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.04 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.04 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>