93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0916 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0916  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  43.5 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  40.97 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0328  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  36.07 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.43 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.18 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.31 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  33 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.88 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.71 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.34 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5594  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  28.32 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal  0.356946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.55 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.04 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  27.42 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.08 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  31.19 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.95 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  23.97 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  24.41 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  31.34 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  40.79 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.52 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  31.36 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  25.78 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04011  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.502053  normal  0.216164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  30.77 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  35.58 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  27.78 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  34.38 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1688  HAD family hydrolase  23.39 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  25.5 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  25.42 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  28.41 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.35 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  24.58 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.37 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  26.45 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  28.41 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 232 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 228 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 219 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 178 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2787  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 230 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 204 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  33.7 
 
 		 241 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8077  predicted protein  33.04 
 
 		 151 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  23.58 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>