More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0328 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0328  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  46.22 
 
 
234 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  46.79 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0916  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.07 
 
 
236 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  28.35 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  37.82 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  33.1 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  24.1 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.05 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.57 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  33.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  35.83 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 
261 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
253 aa  55.1  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  32.33 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  30.25 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.06 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  38.61 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.51 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  23.66 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  41.03 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  31.58 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  33.6 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  29.37 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.23 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
319 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0261  phosphoglycolate phosphatase, C-terminal region  45 
 
 
104 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  25.39 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.89 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  26.72 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
206 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 
235 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  25.33 
 
 
227 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.88 
 
 
197 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.46 
 
 
227 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  49.09 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  23.12 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  39.74 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  27.78 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  49.09 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.64 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  25 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  40.24 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  30.08 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  22.94 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.51 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.9 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.23 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  32.19 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  39.29 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  38.67 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.61 
 
 
190 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>