More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1868 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  57.42 
 
 		 257 aa  298  8e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  49.81 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03461  phosphatase  41.92 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04011  HAD family hydrolase  38.08 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.502053  normal  0.216164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1688  HAD family hydrolase  38.08 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.96 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0693  hypothetical protein  33.94 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0116398  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.7 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.7 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  29.54 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.3 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  28.24 
 
 		 244 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  27.15 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  26.69 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  25.32 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.93 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  30.33 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1917  phosphatase  30 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.24 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  23.55 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  25.41 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  25.88 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  28.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  24.09 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.21 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  24.59 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  25.2 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  25.4 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  25.74 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  24.3 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  25.89 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.29 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.87 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  26.06 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.2 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  27.75 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  27.75 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  23.38 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.85 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  25.55 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  24.29 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  24.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  23.33 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  25.83 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.5 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  25.21 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.19 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.54 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>