More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4292 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  88.59 
 
 		 184 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  75.38 
 
 		 197 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  72.96 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  71.57 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  70 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  70.92 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  70.92 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.62 
 
 		 198 aa  256  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  69.63 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  69.11 
 
 		 198 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.14 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  62.57 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.92 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.92 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  52.63 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  49.73 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  48.3 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  51.12 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  41.24 
 
 		 204 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  38.82 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  37.29 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  38.82 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.82 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  33.33 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.96 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  35.39 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  35.39 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  35.12 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  30.43 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  37.65 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  30.64 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  31.07 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.83 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.07 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  38.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  38.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.07 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.08 
 
 		 319 aa  64.7  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  33.57 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.49 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.95 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.57 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.67 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  36.36 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  39.6 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  31.21 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  31.21 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  34.82 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.06 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>