More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4773 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  96.91 
 
 		 196 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  96.91 
 
 		 196 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  91.24 
 
 		 196 aa  329  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  83.42 
 
 		 197 aa  296  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  71.57 
 
 		 196 aa  288  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  75.54 
 
 		 184 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  75.66 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  75.66 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.37 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  72.92 
 
 		 197 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  70.37 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  67.6 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  53.59 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  51.09 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.07 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.3 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  51.05 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  54.97 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  40.72 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.29 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  39.29 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  39.29 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  37.65 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  37.65 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  36.69 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  30.06 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  30.23 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  31.06 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  30.11 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  35.12 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  37.06 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  43.1 
 
 		 242 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.68 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.18 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  41.38 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  41.38 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.89 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.7 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  39.58 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.27 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.89 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  38.84 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  34.71 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  38.84 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.09 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  32.95 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.26 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  42.22 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.1 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  43.02 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.88 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.52 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.52 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>