More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1887 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  69.11 
 
 
191 aa  272  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  64.25 
 
 
197 aa  265  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  63.08 
 
 
195 aa  259  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.58 
 
 
188 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  35.96 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.75 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  34.27 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.75 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.75 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.75 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.75 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.16 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.05 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.58 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.16 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  28.73 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.98 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  28.8 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.51 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.05 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  29.57 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  29.57 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  29.57 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.56 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.74 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  30.99 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.98 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.98 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  28.18 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  32.72 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  31.89 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  28.08 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.54 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.11 
 
 
296 aa  68.2  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.84 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  26.7 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.22 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  32.78 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  29.74 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  28.32 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  23.5 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  30.98 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.59 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.55 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.65 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.86 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  28.25 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  29.89 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.89 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.46 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  26.32 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.53 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>