More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0904 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  100 
 
 
197 aa  390  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  79.06 
 
 
191 aa  319  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  64.25 
 
 
196 aa  265  5e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  64.25 
 
 
195 aa  261  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
238 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  32.77 
 
 
218 aa  84.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.72 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.19 
 
 
223 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.98 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.98 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.78 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  30.41 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  30.41 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  30.41 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  30.99 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  29.82 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  30.99 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  29.82 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  30.41 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.61 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.24 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.46 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.42 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.26 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  28.07 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  29.82 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  29.24 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  27.49 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  29.29 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.25 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  27.14 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.15 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  26.86 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  26.9 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  26.9 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  26.9 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.54 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  29.89 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  24.86 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.07 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  28.07 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  29.14 
 
 
468 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  23.2 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.28 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  31.55 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  25.95 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.31 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
396 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.94 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  29.12 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.32 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.28 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  26.14 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  24.43 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.87 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  30.06 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  28.41 
 
 
229 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.94 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.48 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.26 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>