More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2613 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
273 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
212 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.27 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.27 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  36.71 
 
 
211 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.58 
 
 
222 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  25.84 
 
 
214 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  34 
 
 
205 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  28.29 
 
 
211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
213 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.32 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
213 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.29 
 
 
211 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 
211 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 
213 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  32.7 
 
 
221 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.03 
 
 
216 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 
211 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
218 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
224 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
210 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
219 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.28 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.21 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  32 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 
222 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.06 
 
 
207 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  32.06 
 
 
207 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 
221 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 
221 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.37 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
226 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.13 
 
 
216 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  27.23 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.75 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  32.38 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.01 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.35 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  32.51 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.11 
 
 
229 aa  79  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  32.51 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  27.57 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.43 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.12 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.58 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  28 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  23.21 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  26.01 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.65 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.46 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.53 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.95 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  24.78 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  29.49 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.25 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  24.57 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>