More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0276 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  100 
 
 		 327 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  96.43 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  64.73 
 
 		 224 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.29 
 
 		 224 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  65.62 
 
 		 224 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  65.62 
 
 		 224 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  63.84 
 
 		 224 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  64.73 
 
 		 224 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  64.73 
 
 		 224 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  64.29 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  64.29 
 
 		 224 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  61.61 
 
 		 224 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  60.09 
 
 		 224 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  61.43 
 
 		 224 aa  275  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  60.83 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  58.74 
 
 		 224 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.88 
 
 		 224 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  57.73 
 
 		 233 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  53.62 
 
 		 232 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  60.99 
 
 		 224 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.43 
 
 		 224 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  51.79 
 
 		 228 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 232 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.57 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.13 
 
 		 220 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.15 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 215 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.16 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 		 229 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 233 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 221 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  30.59 
 
 		 246 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.63 
 
 		 233 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 		 234 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 		 223 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 		 223 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.22 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.76 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  29.48 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.98 
 
 		 216 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  31.92 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.81 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  33.71 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.21 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.71 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.13 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  27.01 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  32.79 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.39 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 		 735 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  30.3 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30.06 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.93 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  32.97 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  24.34 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.13 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  29.95 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  33.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  33.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  33.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  33.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.77 
 
 		 965 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  31.28 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  33.02 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.18 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.96 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  35.29 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  31.03 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>