More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0243 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  86.57 
 
 		 217 aa  354  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  71.76 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  67.74 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  63.21 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.92 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  44.29 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  43.78 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.6 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.65 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  46.01 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  41.31 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  44.83 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  40.76 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  47.2 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  44.8 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  45.81 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.3 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  47.69 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.58 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  45.32 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  41.83 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  42.7 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  43.05 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.01 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  43.62 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  41.89 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  41.15 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.83 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.18 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  45.11 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.33 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.36 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.31 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  42.65 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  41.94 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  40.67 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  44.57 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  44.57 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  42.55 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.72 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  40.19 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  40.67 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  44.34 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  40.19 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  40.19 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  40.19 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  40.67 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  38.38 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.71 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.67 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  40.67 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.86 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  43.52 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  39.91 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  39.44 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  39.91 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  43.35 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  39.44 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  39.44 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  41.4 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.32 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  39.15 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  39.44 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  35.24 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  34.43 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.92 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>