More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4703 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  100 
 
 
224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.97 
 
 
223 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.97 
 
 
226 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.81 
 
 
222 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.81 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  54.38 
 
 
227 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  54.38 
 
 
227 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  52.51 
 
 
222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  52.53 
 
 
227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  58.94 
 
 
216 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  54.4 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  54.73 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  49.41 
 
 
224 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.12 
 
 
215 aa  154  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.79 
 
 
214 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  45.51 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  40.78 
 
 
218 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.21 
 
 
220 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  42.33 
 
 
218 aa  141  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  42.61 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.18 
 
 
224 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  42.94 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  42.94 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  42.94 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  41.48 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.46 
 
 
222 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.8 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  44.74 
 
 
735 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.2 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  41.24 
 
 
218 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.15 
 
 
379 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  47.74 
 
 
234 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  41.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  41.81 
 
 
216 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  31.43 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  42.14 
 
 
231 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  41.11 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  41.11 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  41.11 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  41.11 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  41.11 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 
250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  42.05 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.48 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  35.96 
 
 
411 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  37.09 
 
 
237 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  38.95 
 
 
237 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  32.74 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.07 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  36.41 
 
 
253 aa  94.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  35.75 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  35.41 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  34 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.58 
 
 
327 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  34.56 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  31.89 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3229  putative hydrolase  38.15 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0208525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.51 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.5 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  31.03 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  35.76 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  33.17 
 
 
215 aa  72  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.6 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.63 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  36.63 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.07 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.51 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  33.33 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.82 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.64 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  32.83 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>