More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0148 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  65.38 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  53.67 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.25 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.07 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.9 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  36.76 
 
 		 206 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  37.16 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  34.39 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  33.85 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  34.22 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  33.86 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.46 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  31.39 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.56 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.1 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.57 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  27.17 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.37 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.26 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.37 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.41 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.42 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  25.27 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  25.54 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.96 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  29 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  29 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.25 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.45 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.9 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.98 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  28.41 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.87 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.67 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.74 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  25.51 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  26.26 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  35.16 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1917  phosphatase  24.48 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.38 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2916  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.93 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0271792  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  26.4 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01945  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13290)  25.88 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0940209 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.44 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  30.2 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  26.4 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.13 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>