More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2255 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  100 
 
 		 228 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  90.75 
 
 		 253 aa  356  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  50.25 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.15 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  45.37 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  45.37 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  45.37 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  42.29 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.4 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  42.04 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.23 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.61 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  40 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  31.88 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  43.56 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  41.56 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  39.83 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  45.1 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.78 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.82 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  41.9 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.63 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.75 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  32.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  39.36 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.7 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.04 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  44.12 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  44.12 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  44.12 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  43.14 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  43.14 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  40.66 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  37.88 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.6 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  23.2 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.61 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.69 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.02 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.18 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.65 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  36.76 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  33.72 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.11 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  41.58 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  36.11 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  37.76 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  38.94 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  33.6 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  39.24 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  33.33 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  34.65 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>