More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  41.03 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.12 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.1 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.98 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.88 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.13 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  40.23 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.65 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  25.21 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  24.57 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.73 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.96 
 
 
133 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  41.56 
 
 
292 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.91 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.64 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.33 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.96 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.58 
 
 
456 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  33.08 
 
 
378 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  34.31 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  29.61 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  37.8 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  37.8 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.65 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.84 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.68 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  32.89 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.32 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  36.59 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.05 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.01 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.84 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  30.61 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.07 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
456 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.26 
 
 
349 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  36.56 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.87 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
260 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.71 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.63 
 
 
273 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.7 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  27.34 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.3 
 
 
203 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.5 
 
 
219 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  25.81 
 
 
234 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
215 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  29.84 
 
 
216 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.37 
 
 
583 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  29.59 
 
 
214 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
272 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.91 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.74 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  28.97 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  40 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.73 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.52 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  31.48 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  36.73 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.04 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>