142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2946 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  100 
 
 		 378 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  80.68 
 
 		 207 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.33 
 
 		 218 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0394  hydrolase  45.55 
 
 		 210 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.84 
 
 		 215 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  39.38 
 
 		 216 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.76 
 
 		 204 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3707  HAD family hydrolase  32.05 
 
 		 172 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  28.06 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.87 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.76 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  27.44 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.04 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.08 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  30.94 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  30.22 
 
 		 203 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 227 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 		 224 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 193 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.15 
 
 		 220 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  28.9 
 
 		 292 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  24.88 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  32.23 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  30.3 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  36.84 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.85 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.42 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 		 248 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 203 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 220 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.23 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.79 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0492  hydrolase  35.09 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.07 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  25.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12811  hypothetical protein  20.41 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.434778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  23.41 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  23.3 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.39 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  23.83 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  25.12 
 
 		 205 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 226 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.13 
 
 		 200 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.35 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  41.51 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  25 
 
 		 212 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  19.31 
 
 		 218 aa  46.2  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  21.88 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  26.46 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  28.26 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  21.99 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  23.47 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  26.56 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  24.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.54 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  25.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  22.86 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.23 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.81 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  24.21 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  24.48 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  29.6 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  20.94 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  23.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  25.93 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  36.84 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  25.74 
 
 		 214 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0566  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  27.93 
 
 		 178 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>