214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06091 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  71.71 
 
 		 205 aa  322  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  50.5 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  32 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  30.96 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.85 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  30.52 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  29.56 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  25.49 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.92 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.5 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  27 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.32 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  28.3 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  27.54 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.01 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.05 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  27.49 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.49 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  25.6 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.76 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.71 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  24.27 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  30.19 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.11 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.85 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  42.11 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  26.67 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.57 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  24.88 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  24.88 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  24.88 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  32.43 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  24.88 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  24.88 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  38.57 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  38.16 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  31.68 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01012  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12880)  29.32 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  24.87 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.76 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.26 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.26 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.76 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  25.13 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  25.13 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  23.9 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  23.9 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>