158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0887 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.49 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.42 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.37 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  42.64 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  39.9 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.63 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  37.44 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  35.18 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.76 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  38.05 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0874  HAD family hydrolase  39.5 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12893  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.85 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  35 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  32.2 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  34.18 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  33.67 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  36.76 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3272  HAD family hydrolase  34.86 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.24 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  31.12 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0764  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.523693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  32.85 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.08 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  29.21 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  22.84 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  26.24 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  28.95 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.47 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  29.69 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  29.69 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  29.69 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  29.69 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  29.69 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  22.73 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.32 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.61 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.05 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  33.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  35.58 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.16 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.27 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.11 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.11 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  34.86 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  26.8 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  26.8 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.18 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.53 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  26.8 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  31.16 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  35 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.18 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>