More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3116 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  53.8 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.72 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  40.21 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0874  HAD family hydrolase  41.88 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12893  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.03 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  39.13 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  34.72 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  39.8 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3272  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  39.8 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  39.29 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  40.31 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.79 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  36.51 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.1 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.64 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  31.84 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  29.69 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  34.13 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0764  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.523693  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  33 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  22.34 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.23 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  48.65 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.94 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.91 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  43.96 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  39.09 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.14 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.37 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  33.91 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.3 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  31.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  31.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.02 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  31.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  31.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.94 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  31.65 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  48.21 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  46.43 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.17 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.06 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31.39 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  30.56 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  38.55 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  40.85 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  34.38 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  30.66 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  36.49 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.3 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  30.56 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>