278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4259 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
203 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  82.5 
 
 
203 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  44.1 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  33.87 
 
 
201 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.55 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  28.57 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.05 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.36 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  30.86 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  38.24 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17550  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.23 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0434357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  30.54 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  40.43 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.21 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.19 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.15 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  35.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.28 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.82 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  27.41 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.96 
 
 
194 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
241 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 
252 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.81 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  35.63 
 
 
231 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  32.99 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
243 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  34.12 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.67 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.57 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1182  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142459  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  30 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  22.58 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  32.94 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  35.38 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.42 
 
 
263 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 
229 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
252 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.1 
 
 
232 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
252 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.05 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
230 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
252 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
252 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  31.53 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  24.63 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.59 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.86 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.05 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.07 
 
 
583 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  26.4 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  32.05 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>