269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4436 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  84.43 
 
 
214 aa  370  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1070  hypothetical protein  85 
 
 
105 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.66 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  28.72 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.62 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.48 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  32.76 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.33 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  34.88 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  25.85 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  26.4 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  37.5 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  37.63 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27.92 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.88 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  24.88 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.89 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37 
 
 
133 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  32.99 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.58 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.33 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.74 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  27.27 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  30.53 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  34.04 
 
 
238 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.36 
 
 
133 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.46 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.73 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  36.89 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  26.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.84 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  29.25 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  29.53 
 
 
196 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
235 aa  52  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  34.95 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  32.99 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  45.16 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  32.65 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.56 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  28.57 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  28.57 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  31.33 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  25.49 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.86 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.78 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1676  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.24 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  30.93 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.13 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  30.93 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.66 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  33.93 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.68 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.86 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
226 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  32.56 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  24.38 
 
 
292 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  31.46 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>