292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0649 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  82.86 
 
 
212 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  81.43 
 
 
210 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  80.95 
 
 
212 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  63.55 
 
 
213 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  58.77 
 
 
215 aa  235  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  58.57 
 
 
213 aa  234  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  53.77 
 
 
220 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  56.67 
 
 
214 aa  221  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  46.7 
 
 
219 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01012  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12880)  30.43 
 
 
261 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  30.05 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  29.44 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.4 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.85 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.17 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.37 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  27.84 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  27.84 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  27.84 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  27.84 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  27.84 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  35.14 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.48 
 
 
133 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  31.97 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31.97 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.6 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  26.18 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  26.18 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  27.75 
 
 
196 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  25.65 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.08 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  25.25 
 
 
219 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  40.91 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  36.84 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.33 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  32.43 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  25.51 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.28 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  35 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.74 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  26 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.67 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  26.02 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.05 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.62 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  25.63 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  36 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  37.14 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  23.53 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.64 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  27.04 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.38 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  27.88 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  36.9 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.9 
 
 
280 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.75 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  25.62 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.58 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  30.77 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.77 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  33.78 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.02 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  27.54 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  28.91 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>