143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0909 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.06 
 
 
211 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.44 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.9 
 
 
204 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  35.75 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.96 
 
 
199 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.44 
 
 
199 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.44 
 
 
199 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  30.93 
 
 
199 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  30.93 
 
 
199 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  30.93 
 
 
199 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  30.93 
 
 
199 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  30.41 
 
 
199 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  30.93 
 
 
199 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  34.55 
 
 
208 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  32.28 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  29.32 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  29.32 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.32 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.05 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  28.8 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  28.35 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.32 
 
 
203 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  29.84 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.79 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  24.15 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  32.32 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.86 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  27.23 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.32 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.56 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  27.75 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  28.89 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  25 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.25 
 
 
298 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  23.88 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.93 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.23 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  25.67 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  27.75 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  21.28 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.35 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.1 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  28.23 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.74 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.44 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  27.23 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  22.6 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  29.61 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  25.13 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  25.13 
 
 
217 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  25.13 
 
 
204 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
217 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  23.9 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  25.13 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  24.62 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.65 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  25 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.21 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  24.48 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  24.65 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.42 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.03 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.15 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  23.67 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  24.88 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.5 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  23.36 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.75 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  25.59 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>